邓明华

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个人概况

姓    名:邓明华

职    称:教授

职    务:

研究方向:生物信息学

通信地址:北京大数学科学学院

电    话:62767562

电子邮件:dengmh@math.pku.edu.cn

教育情况

1994/09 – 1998/01,北京大学,数学科学学院,博士,导师:钱敏

1991/09 – 1994/07, 北京大学,数学系,硕士,导师:钱敏

1987/09 – 1991/07, 北京大学,数学系,学士

工作经历

2009/07-至今,北京大学,数学科学学院,教授

2009/08-2010/01, 美国耶鲁大学,医学院流行病与公共卫生系,访问副教授,合作导师:Hongyu Zhao

2003/08-2009/07,北京大学,数学科学学院,副教授

2001/01-2003/08,美国南加州大学,计算生物学中心,博士后,合作导师:Fengzhu Sun

1998/04-2003/07,北京大学数学科学学院,讲师

科研项目(973、科技部重点研发计划等)

1. 科技部重点研发,2016YFA0502300,蛋白质机器三维结构导向的新型药物研发关键技术研究,2016/07-2021/06,50万;参加;

2. 国家自然科学基金面上项目,31471246,基于网络的全基因组关联分析方法,2015/01-2018/12; 70 万元;主持

3. 科技部973项目,2015CB910300,基于蛋白质调控网络的系统生物学研究--疾病相关生物分子网络的构建、动态演化及调控规律,2015/01 - 2019/12;571万元;课题组长;

4. 国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究项目(31428012)生物网络研究中的统计方法及其应用,2015/01-2016/12; 20万元; 合作主持;结题;

5. 国家自然科学基金面上项目,31171262,遗传相互作用网络的构建与分析,2012/01-2015/12,60 万元,主持,已结题

6. 国家自然科学基金创新团队,11021463,生物网络研究;2011/01-2013/12;研究骨干,已结题

7. 科技部973项目(2009CB918503)基于蛋白质结构与相互作用的计算生物学研究--蛋白质相互作用网络形成的结构基础与动力学分析;2009/01-2013/12;103.8 万元;研究骨干,已结题

8. 科技部863项目(2008AA02Z306)蛋白质复杂网络构建与分析及其在肝癌疾病中的应用;100 万;主持,已结题

9. 国家自然科学基金创新团队 生物网络研究;2008/01-2010/12;研究骨干,已结题

10. 国家自然科学基金面上项目,10871009,基于探针杂交机制的生物芯片数据预处理统计方法研究;2009/01-2011/12;24 万元;主持人,已结题

11. 科技部 973 项目,2003CB715903,基因功能预测的生物信息学理论与应用-基于序列与结构的蛋白质功能预测;研究骨干,已结题

12. 国家自然科学基金面上项目,30570425,转录因子结合位点(TFBS) 研究;2005/01-2008/12;28 万元;主持,已结题

著作文集(期刊专著等)

(1) Fang HY, Huang CC, Zhao HY, Deng MH*: CCLasso: correlation inference for compositional data through Lasso. Bioinformatics 2015, 31:3172-3180.

(2) Fang HY, Huang CC, Zhao HY, Deng MH*: gCoda: Conditional Dependence Network Inference for Compositional Data. Journal of Computational Biology 2017, 24:699-708.

(3) Wang ZM, Fang HY, Tang NLS, Deng MH*: VCNet: vector-based gene co-expression network construction and its application to RNA-seq data. Bioinformatics 2017, 33:2173-2181.

(4) Wu CJ, Zhao HY, Fang HY, Deng MH*: Graphical model selection with latent variables.Electronic Journal of Statistics. Vol.11 (2017) 3485–3521.

(5) Yuan HL, Xi RB*, Chen C, Deng MH*: Differential network analysis via lasso penalized D-trace loss. Biometrika 2017, 104:755-770.

学术荣誉(获奖情况)

1999年,优秀主干基础课及教学优秀奖(高等数学B,郑志明)

社会服务(社会兼职、杂志编委等)

1999年秋-2001年春,1999级二班班主任

1998年-2001年,数学模型竞赛组织

2004年-2007年春,2004级硕士二班班主任